Národopisná sbírka je velmi rozsáhlou sbírkou, jejíž náplní je ukázka života venkovského lidu, lidové umění a tvorba obyvatel jihočeských Blat a Kozácka .
V Soběslavi, která je přirozeným centrem oblasti nošení etnograficky zajímavého blatského kroje, vznikl základ národopisných sbírek v souvislosti s Národopisnou výstavou v Praze 1895 a Národopisnou, školní a průmyslovou a včelařskou výstavou v Soběslavi , která se konala na oslavu otevření muzea v Soběslavi 1898.
Hlavní zásluhu na tom měli učitelé Emilie Fryšová (1840 - 1920), Karel Lustig (1856 - 1924) a hodinář Alois Březina. V jejich práci pokračovali, učitel Antonín Jungman (1854 - 1945), archivář Jan Lintner, učitel Jaroslav Brodský, Václav Křísa a zejména dlouholetá pracovnice a ředitelka soběslavského muzea Věnceslava Prokešová.
V roce 1978 bylo soběslavské muzeum spojeno s Muzeem husitského revolučního hnutí v Táboře (nyní Husitské muzeum) a Smrčkův dům je jeho národopisným pracovištěm.

Sbírka obsahuje několik kompletních krojů blatských i kozáckých, tj. z oblasti  veselsko-soběslavských Blat a Kozácka (severní Táborsko). Jedná se převážně o kroje ženské, ale zastoupen je i kroj mužský a několik dětských, většinou dívčích. Vedle kompletů je zde však mnoho jednotlivých součástí krojů, z nichž převládají pleny, s charakteristickou originální výšivkou. Nechybí ani domácí textil, převážně z plátna, které si vesničané tkali sami doma na stavu, či z vlny, kterou  ženy předly na přeslicích a kolovratech.
Vedle předmětů používaných v  domácnostech, z keramiky (nádobí, perníkové formy, dekorační předměty), různých ručně vyrobených dřevěných předmětů (roubík na vázání obilí, štoudev na vodu),  nástrojů a nářadí pro podomáckou výrobu (stav, přeslice, kolovrat), nechybí ani různé zemědělské nářadí (pluh, postroje na dobytek, rotační mlýnek na obilí), je zde i nářadí, používané na blatech k výrobě borků, (brikety z rašeliny, které se vykrajovaly tvarovaným želízkem). Z dekoračních předmětů převládají obrázky malované na skle, většinou s náboženskou tématikou, křížky a lidové  plastiky.
Ve sbírce je i mnoho listinného materiálu, a to různých rukopisů, tisků, převážně náboženských a lidových (kramářských) písní, dokumentace, dokladů a fotografií.

Celkem 19 642 kusů. Zpracováno 14 372 kusů.
Současným správcem sbírky je Martin Kovář.

Různorodá sbírka skládající se z původního vybavení pobočky muzea. Zastoupeny jsou tu různé předměty z obchodů, náčiní a nářadí z dílen, vybavení domácností, včetně sady převážně cínového nádobí. Zastoupeny jsou i obrazy, plastiky, mapy, fotografie, církevní textilie (řada ornátů) a liturgické předměty (mosazné, cínové i dřevěné svícny, litinové kříže). Nachází se zde i kolekce měšťanských oděvů s různými doplňky.

Celkem 4 641 kusů.
Současným správcem sbírky je Vít Vlasák.